فصل اول: مقدمه
سرطان مری
تعیین مرحله بیماری
عوامل خطرزا در ابتلا به سرطان مری
تغییرات مولکولی در سرطان مری
تغییرات مولکولی در EAC
تغییرات مولکولی در EACC
درمان های رایج سرطان مری
جراحی
رادیوتراپی
شیمی درمانی
لیزر درمانی
فتودینامیک
پروتئین EpCAM
مسأله ی تحقیق
فصل دوم: مروری بر تحقیقات انجام شده
EpCAM در درمان سرطان
فصل سوم: مواد و روش ها
مواد مورد استفاده
باکتری مورد استفاده
پلاسمید
انزیم ها
کیت های ازمایشگاهی
انتی بیوتیک ها
محیط کشت باکتری
ژل الکتروفورز
مواد شیمیایی
وسایل و تجهیزات ازمایشگاهی
طراحی و انالیز بیوانفورماتیکی مولتی توپ پروتئین EpCAM
طراحی مولتی توپ کایمر
بهینه سازی توالی یا Optimization
پیش بینی ایمیوژنیک اپی توپ های سلول های B
پیش بینی ایمیوژنیک اپی توپ های سلول های T
پیش بینی میزان تمایل اتصال اپی توپ ها به MHC
پیش بینی ساختار دوم mRNA
پیش بینی ساختار دوم پروتئین
شناسایی نواحی تداخل کننده
تعیین ساختار سوم پروتئین
تعیین میزان انتی ژنیک بودن و محلول بودن پروتئین
تعیین میزان پایداری پروتئین
سنتز شیمیایی DNA کایمر طراحی شده
سنتز شیمیایی ژن نوترکیب
پایداری و شرایط نگهداری DNA سنتز شده
محلول سازی DNA لیوفیلیزه
کلونینگ پلاسمید AMP+ pBSK حاوی DNA مولتی توپ EpCAM
اماده سازی باکتری شایسته
مواد و محلول ها
روش کار
ترانسفورماسیون پلاسمید به سلول های مستعد TOP Ecoli
روش کار
ارزیابی کلونی ها
استخراج پلاسمید AMP+ pBSK حاوی DNA مولتی توپ EpCAM
تایید آنزیمی پلاسمید استخراج شده
هضم آنزیمی دوگانه یا Double digestion
الکتروفورز
ساب کلونینگ ژن مولتی توپ EpCAM
تخلیص DNA مولتی توپ EpCAM از ژل
لایگیشن
ترانسفورماسیون
اماده سازی سلول های شایسته
ترانسفورماسیون سلول های شایسته Ecoli BL(DE) با محصول لایگیشن
ارزیابی کلونی ها
استخراج پلاسمید بیانی peta حاوی ژن مولتی توپ EpCAM
تایید انزیمی پلاسمید استخراج شده
بیان پروتئین مولتی توپ EpCAM
القاء بیان پروتئین به کمک IPTG
بررسی بیان به کمک تکنیک SDSpage
روش ساخت محلول ها و ژل ها
Run کردن نمونه ها
رنگ امیزی با کوماسی G کلوئیدی
فصل چهارم: نتایج
نتایج حاصل از طراحی و انالیز بیوانفورماتیکی پروتئین EpCAM
مولتی توپ کایمر طراحی شده
نتایج حاصل از بهینه سازی توالی یا Optimization
انالیز ساختار mRNA
ساختار دوم پروتئین
پیش بینی ایمیوژنیک اپی توپ های شناسایی شونده توسط سلول های لنفوسیتB
پیش بینی اپی توپ های شناسایی شونده توسط سلول های لنفوسیت T
پیش بینی تمایل اتصال پپتید ها به مولکول MHC
شناسایی نواحی تداخل کننده
پیش بینی ساختار سوم پروتئین
نتایج حاصل از تعیین میزان آنتی ژنیک بودن و محلول بودن پروتئین
بررسی پایداری پروتئین نوترکیب
سنتز شیمیایی DNA کایمر طراحی شده نو ترکیب
کلونینگ پلاسمید AMP+ pBSK حاوی DNA مولتی توپ EpCAM
ساب کلونینگ ژن مولتی توپ EpCAM
بیان پروتئین مولتی توپ EpCAM و تائید ان به کمک تکنیک SDSpage
فصل پنجم: بحث و نتیجه گیری
بحث
نتیجه گیری
محصول های مرتبط
انالیز بیوانفورماتیکی، کلونینگ و بیان ناحیه خارج سلولی 166CD در میزبان پروکاریوتی
فصل اول: مقدمه سرطان سرطان کولورکتال سرطان کوورکتال عوامل خطرزا در ابتلا به سرطان کولورکتال تغییرات مولکولی در سرطان تشخیص…
ارزیابی کارایی اوره بعنوان یک منبع نیتروژنی ارزان در تولید اریترومایسین توسط Saccharopolyspora erythraea به روش فرمانتاسیون
فصل اول: کلیات هدف بیوتکنولوژی میکروبی روشهای سنتی میکروبیولوژی صنعتی بیوتکنولوژی میکروبی نوین جنبههای اقتصادی بیوتکنولوژی میکروبی مقدمه ای بر…
ارزیابی برون تنی پیگمان های میکروبی بدست آمده در مرحله غربالگری به منظور جاذب اشعه ماورای بنفش در کرم های ضد آفتاب
فصل اول: کلیات تحقیق ۱-۱- مقدمه ۱-۲- هدف از انجام این تحقیق ۱-۳- پیگمان های میکروبی ۱-۳-۱ تعریف پیگمان های…
شیوع ژن های شیگاتوکسین و اینتیمین در سویه های اشریشیا کلی O157:H7 جدا شده از عفونت ادراری در شهرستان الشتر
چکیده : باکتری E.coliO157H7 یکی از عوامل اصلی ایجاد کننده مسمومیت غذایی و بیماری هایی مانند : اسهال، کولیت خونریزی…
بررسی تنوع ژن Coa در استافیلوکوکوس اورئوس های جدا شده از نمونه های بالینی در رشت
استافیلوکوکوس اورئوس از عوامل بیماریزای متداول در انسان و دام است که طیف وسیعی از بیماریها را ایجاد میکند و…
بیان وتخلیص پروتئین نوترکیب DR2418 داینوکوکوس رادیودورانس در اشریشیا کلی
زمینه و اهداف: داینوکوکوس رادیودورانس یکی از میکروارگانیسم های مقاوم به پرتو است و می تواند در محیط های خشن…
قوانین ثبت دیدگاه